Bilevel optimization and multicriteria approximations: application to computational protein design
Samuel Buchet  1@  , Marianne Defresne  2  , Simon De Givry  1@  , Manon Ruffini  2  , Thomas Schiex  1@  
1 : Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse
Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement : UR0875
2 : Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse
Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement : UR0875

In this presentation, we present the computational protein design
problem and its extensions to multistate negative design. The single
state design can be modelled as a pure discrete optimization problem.
The multistate negative design is a more challenging problem that
requires either bilevel or bicreteria optimization depending on the
energy model. We explored both directions and present some preliminary
results.


Personnes connectées : 2 Vie privée
Chargement...